細胞核的結構充當線索,可以長期以來看到細胞健康或受疾病影響。儘管科學家在理解其基因和職責方面取得了很多進展。但是很難將我們在顯微鏡下看到的內容與DNA中發生的事情聯繫起來。現在,新方法有助於將這兩個世界融合在一起。
哈佛大學的Jason Buenrostro博士的Ajay Labee博士,Zachary Chiang博士和Caroline Comenho博士以及哈佛大學Jason Buenrostro博士的研究人員創建了一種名為“擴展身份”的新技術。該研究發表在科學期刊上。
Exigs允許研究人員在細胞核中看到細胞核內的DNA和重要蛋白質 – 細胞的控制中心。這與以前的技術不同。這有助於科學家了解這些分子如何在太空中排列並相互作用。該小組使用這種方法研究了Hutchinson-Gilford,Proterer(HGP)的人的細胞,該細胞是一種罕見的疾病,可讓兒童迅速衰老。
他們發現這些細胞的異常形狀與某些基因的閉合之間的意外聯繫。在健康的細胞聖染色質中,這是一種鬆散且使用的DNA格式,這些基因將使細胞正常工作,但是在後代細胞中,通常發現DNA在某些區域被發現是封閉的。這指出,核形狀的變化可能足以關閉重要的基因。
“層粘連蛋白的異常與異常的白染色質的最熱熱點有關,這可能是細胞異常獨特的。” Bua Nototo博士說,層粘連蛋白是核支持的一部分。這意味著,當這種支撐的結構被打破時,它可能是沉默的基因,可以發揮其獨特的作用。
確認其方法的可靠性。研究人員表明,Exigs像以前一樣保留核的自然結構,同時提供的細節比以前的訂單方法高約十倍。他們結合了這一點並標記為熒光街,如何創建特定的分子,以便能夠遵循以查看染色體(帶有DNA的結構)如何將這些活性移動和將這些活性轉移到基因活性的方式。
“拉明異常的出現涉及令人不安的地區的頻率越來越多。” Labade博士說,他觀察到,儘管這些異常顯然與基因的變化有關,但它們並沒有將舌抑素直接拖到它們。但是效果是斑點和局部的,而不是所有影響的核
他們的觀察結果表明,即使在一個細胞中,也無法預測受這些結構影響的區域。這些問題擴散並傾向於影響基因組區域 – 細胞之間通信中的全遺傳物質的集合。隨機可以使效果更難修復。
Chiang博士回顧了多年的嘗試來達到這一點:“這個項目不僅僅是一個瘋狂的主意:我們可以直接安排在細胞核中,除了我們花費了7年的學術界,它不會在任何地方飛行。此外,他還反映了在這項高級企業中持續籌集資金的重要性,儘管該項目已經獲得了全國研究資本競爭。
這個新工具的重要性比一種疾病太高。 Exigs為探索核的形狀和結構的變化打開了大門,可能在癌症和許多其他條件中起作用。這是一種連接我們在顯微鏡和基因方法下看到的內容的方法。
參考期刊
Labade AS,Chiang ZD,Comenho C.,Reginato PL,Payne AC,Earl AS,Shrestha R.,Duarte FM,Habibi E.,Zhang R.,Boyden ES,Chen F.,Buenrostro JD Bii:doi:doi:doi:doi:doi: https://doi.org/10.1101/2024.09.24.614614
關於作者
Jason Buenrostro博士 是位於哈佛大學和廣泛機構的單一和基因組控制領域的主要研究人員。他開創了各種技術,這些技術揭示了他們的細胞如何組織和控制其DNA,包括採用收養兒童的ATAC-SEQ方法。他的工作著重於將基因組的空間佈置與工作狀況聯繫起來的技術的發展,目的是了解這些過程在疾病中是錯誤的,例如癌症和年齡。 Buenrostro博士對培訓科學家並促進開放和開放的環境有深刻的承諾。他的跨學科方法連接了分子生物學,生物工程和計算科學。

Zak Chiang博士 是一名功能研究人員,他以參與每個細胞中空間基因組和高分辨率DNA圖的分析而聞名。作為哈佛大學的科學家和廣泛的機構,他在身份發展中起著重要作用。 Exigs,這是一種以納米精度查看DNA和核蛋白的一種方式。他的研究是在技術開發和生物學發現的交匯處,尤其是在細胞的物理變化中,可能會影響恰格博士的活動,是一項強大的學術基金籌集和透明的研究指南。

Ajay Blades博士 是一位分子生物學家和技術發起者,專門研究哈佛大學和廣泛研究所的空間細胞的分析。他已經開發了一個Exigs,這是一種新方法,允許科學家研究物理組織和不間斷細胞的工作。通過專注於Labade博士的基礎科學和嚴格性,需要多年才能自定義將細胞結構與大遺傳形式聯繫起來的工具。他的方法包括對先進攝影進行實驗的濕lab和Labade博士的模型的創建,他對好奇心驅動的科學能力充滿信心,強調了學術自由的重要性以及對高風險研究的長期投資的重要性,並獲得了高獎項。
Caroline Comenho 是一位增加身份細胞分支的科學家,這是廣泛研究所和哈佛大學高定義基因組發展的重要組成部分。她的工作重點是理解核結構會影響基因的表達,尤其是在較舊的條件下,涉及Comenho,將專業知識,分子生物學與攝影技術的強大基礎相結合,從而減少了圖像細胞的序列和性質之間的差距。她展示了由技術創新和生物學理解驅動的新研究人員浪潮。